考莉·埃尔南德斯

继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。

詹姆士（詹姆斯·艾伦·麦克卡尼JamesAllenMcCune饰）的姐姐失踪已有二十年之久，而她正是曾经闹得沸沸扬扬的黑森林布莱尔女巫传说中的主角，詹姆士一直坚信，姐姐依然生活在黑森林的某个角落。某日，詹姆士在网上看到了一段诡异的视频，而录下这段视频的人正是自己的姐姐，为了寻找姐姐的下落，詹姆士和好友皮特（布兰登·斯考特BrandonScott饰）、丽莎（考莉·赫尔南德斯CallieHernandez饰）和艾什莉（科宾·瑞德CorbinReid饰）一起，决定故地重游。詹姆士找到了上传视频的兄妹两人，在他们的引导下，一行人渐渐深入黑森林。黑森林秀美的景色令皮特和艾什莉放松了戒心，然而入夜后，接连发生的怪响和无端出现的女巫图腾令他们陷入了恐慌。詹姆士认为是兄妹两人捣的鬼，于是将他们赶走，但事态却并没有因为他们的离开而有所好转。...